Pangokoodin nimilista laajenee edelleen. JN.1 varianttien alaryhmät saavat uusia merkintöjään Omikronien joukossa.

 https://github.com/cov-lineages/pango-designation/blob/master/pango_designation/alias_key.json

 

Huomaa myös rekombinaatiot! 

https://github.com/cov-lineages/pango-designation/blob/master/pango_designation/alias_key.json

"XDD": ["EG.5.1.1","JN.1","EG.5.1.1"],
    "XDE": ["GW.5.1","FL.13.4"],
    "XDF": ["XBB*","EG.5.1.3"],
    "XDG": ["FL.37","EG.5.2.4"],
    "XDH": ["BN.1.2.8","XBB.1.9.1"],
    "XDJ": ["XBB.1.16.6","HK.3.1"],
    "XDK": ["XBB.1.16.11","JN.1.1.1"],
    "XDL": ["EG.5.1.1","XBB*"],
    "XDM": ["XDA","GW.5","XDA"],
    "XDN": ["JN.1.1","JD.1*"],
    "XDP": ["JN.1.4","FL.15"],
    "XDQ": ["BA.2.86.1","FL.15.1.1"],
    "XDR": ["JD.1.1.1","JN.1.1"],
    "XDS": ["EG.5.1.3","JN.3.2.1","EG.5.1.3"],
    "XDT": ["BA.2.86.4","GK.1"],
    "XDU": ["XBB.1.16","BA.2.86.1"],
    "XDV": ["XDE","JN.1","XDE","JN.1"],
    "XDW": ["JN.2","XDA"],
    "XDY": ["LB.1.2.1","KP.3.2"],
    "XDZ": ["JG.3","JN.1.1.10"],
    "XEA": ["JN.1.63.1","EG.5"],
    "XEB": ["FL.15","JN.1.4","FL.15"],
    "XEC": ["KS.1.1","KP.3.3"],
    "XED": ["JN.1.4","LF.1.1.1"],
    "XEE": ["KP.2.3.7", "JN.1"],
    "XEF": ["LB.1.4", "KP.3"],
    "XEG": ["JN.3.2.1","GJ.1.2","JN.3.2.1","GJ.1.2"],
    "XEH": ["KP.1.1.3","KP.3"],
    "XEJ": ["JN.1", "LF.1.1.1"],
    "XEK": ["KP.2.3","XEC"],
    "XEL": ["KS.1.1.2","JN.1"],
    "XEM": ["KS.1","KP.3.3.1"],
    "XEN": ["KP.1.1.6","JN.1.11.1"],
    "XEP": ["KP.3.1.1","NP.2"],
    "XEQ": ["KS.1.1.2","KP.3"],
    "XER": ["KS.2","LF.7"],
    "XES": ["KP.2.3","KP.3.3"],
    "XET": ["KP.1.1.1","KP.3.1.1"],
    "XEU": ["XEK","XEC.8"]
} "XEU": ["XEK","XEC.8"],(Lisään XEU jälkeen tulleet  20.2. 2026. 

    "XEV": ["KP.3.1.1","XEC.18"],

    "XEW": ["KP.3.1.1","XEC.8"],

    "XEY": ["MC.29","XEC"],

    "XEZ": ["MC.6","XEC"],

    "XFA": ["MC.1.1.1","XEC.4.1"],

    "XFB": ["MC.24","XDY.1.1","MC.24"],

    "XFC": ["LP.8.1.1","LF.7","LP.8.1.1"],

    "XFD": ["MC.36.1","XEC"],

    "XFE": ["MC.37","XEC.19"],

    "XFF": ["LB.1.3","MZ.1"],

    "XFG": ["LF.7","LP.8.1.2","LF.7"],

    "XFH": ["LF.7.1.13","XEF","LF.7.1.13"],

    "XFJ": ["LS.2.1.1","LF.7.2","LS.2.1.1","LF.7.2"],

    "XFK": ["KP.3.1.1","XEC.5"],

    "XFL": ["XEU","XEC.18"],

    "XFM": ["LF.7.6.2","LS.2.1.1"],

    "XFN": ["XEC.25.1","LF.7","XEC.25.1"],

    "XFP": ["LS.2.1.1","LF.7","LS.2.1.1"],

    "XFQ": ["LF.7.1.10","XFG.3.1"],

    "XFR": ["LF.7.3","LB.1.11.1"],

    "XFS": ["LF.7.1","LP.8.1.9"],

    "XFT": ["LF.7.7.2","LP.8.1.1"],

    "XFU": ["LF.7.6.2","PG.3.1"],

    "XFV": ["LP.8.1","XFG.3.3.1"],

    "XFW": ["XDY.3","LF.7","XDY.3"],

    "XFY": ["XFG.5.1","NB.1.8.1"],

    "XFZ": ["XFC.3","PG.3.2"],

    "XGA": ["XFJ.4.1","PY.1","XFG.6.2"],

    "XGB": ["NW.1.7","QS.1"],

    "XGC": ["PY.2","XFG.4"],

    "XGD": ["XFJ.4","XFJ.3.1.3"],

    "XGE": ["XFG.2","XFG.14.1"],

    "XGF": ["XFG.3.13","XFG.14.1"],

    "XGG": ["PY.1","XFG.21"],

    "XGH": ["QY.3","PY.1.4","QY.3"],

    "XGJ": ["XFG.10","XFG.17.2.1"],

    "XGK": ["XFG.2.12","XFG.17.2.1"],

    "XGL": ["XFG.3.1.12","XFG.17.2.1"],

    "XGM": ["NY.3.3","LF.7.3","NY.3.3"],

    "XGN": ["XFG.3.5.2","RG.3","XFG.3.5.2"],

    "XGP": ["NY.3.3","XFG.26"],

    "XGQ": ["PP.1.2","XFG.26","PP.1.2"],

    "XGR": ["NW.1.7.4","RN.1"],

    "XGS": ["XFG","PY.1","XFG"],

    "XGT": ["QF.2","PQ.17","QF.2"]

}

https://www.who.int/activities/tracking-SARS-CoV-2-variants

Tilanteessa on jotain erityisen seurattavaa nyt, joten palautan mieleen kooditaulukkoa.  

 

Covid-19 ja Sars-Cov-2 tartunnat vain jatkuvat tosin hiljaiselolla edelleen vuoden 2024 lopulla.

 Rokotuksista on delleen hyötyä. Sairautta aiheuttava omikron varianttien joukko on JN.1  alalinjoista muodostunut ja edelleen ilmentää uusia varianttilinja. Kansanterveysviiraston lähteestä saa kuulla tilanteen ruotsinkielisenä tekstinä.  Suositellaan  ottamaan sekä koronavirusrokote että influenssavirusrokote, varsinkin  yli 65 vuotiaille ja iäkkäimmille   ja riskiryhmille  esitetään suositus.

https://www.folkhalsomyndigheten.se/folkhalsorapportering-statistik/statistik-a-o/sjukdomsstatistik/covid-19-veckorapporter/

Veckorapporter för 2024

• Aktuell veckorapport om covid-19
• Arkiv för covid-19 veckorapporter 2024

Seuraava raportti saadaan viikon 45 lopulla.  

Taulukoitua tietoa: 

Tabellbilaga

Samtliga genetiska grupper i tabell 1 är undergrupper inom omikronvarianten JN.1. Data i tabell 1 är preliminära då sekvenseringsresultat kommer att tillkomma.

Tabell 1. Genetiska grupper enligt pangolin som utgör minst en procent av fall från vecka 38 till och med vecka 41 2024, sekvenserade inom övervakningsprogrammet för SARS-CoV-2.

Genetisk grupp enligt pangolin	Antal sekvenserade fall	Andel av sekvenserade fall (procent)
KP.3.1.1	342	44
XEC	105	14
JN.1.16.5	32	4
MC.1	24	3
MC.13	21	3
MC.16	19	2
LB.1.4	18	2
KP.2.3.6	16	2
KP.1.1.3	13	2
LF.7	13	2
KP.2.3	11	1
KP.3.3	10	1
MC.10	10	1
MC.6	9	1
MC.8	8	1