Leta i den här bloggen

fredag 18 september 2020

Esimerkki Israelin nykyisestä pandemisesta vaiheesta

 i24news kertoo tänään, että Israelissa on pandemian alusta lähtien  todettuja  Covid-19 infektioita 166794. Täysin toipuneiksi katsotaan  120 727 eli yli 72%. C

ovid-19 tautiin kuolleita on todettu 1169 tai toisen tiedon mukaan 1147.  Tästä luvusta laskettuna mortaliteetti Israelissa on 0,687 %. Tarkistan vielä tuosta toisesta luvusta: 0,7%.  Viime tiistaina tehtiin koronavirustestauksia siellä 57 165 kpl.  Torstaina uusia tautitapauksia oli 5238, toisen tiedon mukaan 5523. Vakavassa tilassa on 577 henkilöä. Intuboituina on 149. Armeijasta ilmoitettiin  833 sotilasta ja  IDF siviilivirkmiestä  tartunnan saaneiksi, heillä tauti on aktiivissa vaiheessa ja lieväasteista. Lisäksi  koti-karanteeniin on määrätty 11 845 sotilasta. Koska Israelissa on   vuoden  suurimpiin ja väkirikkaimpiin  juhlatilaisuuksiin perinteisesti kuuluva aika meneillään, valtion johdon taholta on määrätty täysi 3 viikon  lockdown tila valtioon ja virkavalta  valvoo käskyn noudatusta. Tämä juhla-aika perinteisesti sisältää myös  Lehtimajanjuhlan johon on aiemmin tulvinut  koko maailmasta turisteja viettämään suuria joukkotilaisuuksia väkirikkaissa  kaupungeissa. 

Tänään on Uudenvuoden alku. Siirrytään vuodesta 5780 vuoteen 5781. ROSH HASHANA.

Siunattua Uutta Vuotta!

onsdag 9 september 2020

5`UTR ja 3`UTR koronaviruksissa SARS Cov ja MERS CoV

https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/25736566/

Epub 2015 Feb 28.

The structure and functions of coronavirus genomic 3' and 5' ends

Affiliations
Free PMC article

Abstract

Coronaviruses (CoVs) are an important cause of illness in humans and animals. Most human coronaviruses commonly cause relatively mild respiratory illnesses; however two zoonotic coronaviruses, SARS-CoV and MERS-CoV, can cause severe illness and death. Investigations over the past 35 years have illuminated many aspects of coronavirus replication. The focus of this review is the functional analysis of conserved RNA secondary structures in the 5' and 3' of the betacoronavirus genomes. The 5' 350 nucleotides folds into a set of RNA secondary structures which are well conserved, and reverse genetic studies indicate that these structures play an important role in the discontinuous synthesis of subgenomic RNAs in the betacoronaviruses. These cis-acting elements extend 3' of the 5'UTR into ORF1a. The 3'UTR is similarly conserved and contains all of the cis-acting sequences necessary for viral replication. Two competing conformations near the 5' end of the 3'UTR have been shown to make up a potential molecular switch. There is some evidence that an association between the 3' and 5'UTRs is necessary for subgenomic RNA synthesis, but the basis for this association is not yet clear. A number of host RNA proteins have been shown to bind to the 5' and 3' cis-acting regions, but the significance of these in viral replication is not clear. Two viral proteins have been identified as binding to the 5' cis-acting region, nsp1 and N protein. A genetic interaction between nsp8 and nsp9 and the region of the 3'UTR that contains the putative molecular switch suggests that these two proteins bind to this region.

Keywords: Coronaviruses; RNA binding proteins; RNA secondary structure; Virus replication; cis-Acting sequences.