COVID-19 nsp8(3943-4140) 198 aminohappoa

    mat_peptide     3943..4140
                     /product="nsp8"
                     /note="produced by both pp1a and pp1ab" 

FEATURES             Location/Qualifiers
     source          1..198

 /organism="Severe acute respiratory syndrome coronavirus
                     2"
                     /isolate="Wuhan-Hu-1"
                     /host="Homo sapiens"
                     /db_xref="taxon:2697049"
                     /country="China"
                     /collection_date="Dec-2019"
     Protein         1..198
                     /product="nsp8"
                     /note="produced by both pp1a and pp1ab"
                     /calculated_mol_wt=21881
     Precursor       1..198
                     /derived_from="YP_009724389.1:3943..4140"
ORIGIN      
        1 aiasefsslp syaafataqe ayeqavangd sevvlkklkk slnvaksefd rdaamqrkle
       61 kmadqamtqm ykqarsedkr akvtsamqtm lftmlrkldn dalnniinna rdgcvplnii
      121 plttaaklmv vipdyntykn tcdgttftya salweiqqvv dadskivqls eismdnspnl
      181 awplivtalr ansavklq
//

 Kiinasta  ORF1a pp1a  nsp8 jakso 

(3943..4140) aiasefss lpsyaafata
     3961 qeayeqavan gdsevvlkkl kkslnvakse fdrdaamqrk lekmadqamt qmykqarsed
     4021 krakvtsamq tmlftmlrkl dndalnniin nardgcvpln iiplttaakl mvvipdynty
     4081 kntcdgttft yasalweiqq vvdadskivq lseismdnsp nlawplivta lransavklq 

Helsingistä ihan sama:

3943..4140) aiasefss lpsyaafata
     3961 qeayeqavan gdsevvlkkl kkslnvakse fdrdaamqrk lekmadqamt qmykqarsed
     4021 krakvtsamq tmlftmlrkl dndalnniin nardgcvpln iiplttaakl mvvipdynty
     4081 kntcdgttft yasalweiqq vvdadskivq lseismdnsp nlawplivta lransavklq 

Etsin vanhan SARSin 2003  nsp 8  sekvenssin ja kohdan: 

(3920..4117) a iasefsslps yaayataqea yeqavangds evvlkklkks
     3961 lnvaksefdr daamqrklek madqamtqmy kqarsedkra kvtsamqtml ftmlrkldnd
     4021 alnniinnar dgcvplniip lttaaklmvv vpdygtyknt cdgntftyas alweiqqvvd
     4081 adskhvqlse inmdnspnla wplivtalra nsavklq 

Useampi aminohappo vaihtunut;  on ainakin 6 muutosta

SARS 3934 Y muutunut  COVID 3957 F () tyrosiini fenylalaniiniksi)

SARS 4051 V muuttunut 4074 I (valiini isoleusiiniksi)

4055 G muuttunut 4078 N (glysiini asparagiiniksi)

4084 N muuttunut 4087 T (asparagiini threoniiksi)

4085 H muutunut 4108 I (histidiini isoleusiiniksi) 

4092 N muuttunut 4115 S  (asparagiini seriiniksi)