Leta i den här bloggen

måndag 9 mars 2020

COVID-10 nsp11

 https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/QHU79172.1
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/QIA20043.1 
   mat_peptide     4393..4405
                     /product="nsp11"
                     /note="produced by pp1a only"
     CDS             1..4405
                     /gene="orf1a"
                     /coded_by="MT049951.1:266..13483"
                     /note="pp1a"
 
FEATURES             Location/Qualifiers
     source          1..13
                     /organism="Severe acute respiratory syndrome coronavirus
                     2"
                     /isolate="Wuhan-Hu-1"
                     /host="Homo sapiens"
                     /db_xref="taxon:2697049"
                     /country="China"
                     /collection_date="Dec-2019"
     Protein         1..13
                     /product="nsp11"
                     /note="produced by pp1a only"
                     /calculated_mol_wt=1326
     Precursor       1..13
                     /derived_from="YP_009725295.1:4393..4405"
COVID-19 ORIGIN      
        1 sadaqsflng fav
// 
4393.. 4404  sadaqsfl ngfav
 
 
Entä SARS 2003, oliko siellä jokin vastaava nsp11?
 
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/ABA02249.1
löytyy  päätejakso: 21 aminohappoa  )(4362..3281) 
Se mikä on COVID-19 nsp 11,KOLMETOISTA AMINOHAPPOA, 
 kuuluu tuohon jaksoon C-terminaalisesti)
 
4362   qlreplmqs adastflngf
4381  av
löysin maininnan, että  jaksoa 4370..4382 
on kutsuttu nsp11_pp1a  Putative C-terminal 
Cleavage protein of pp1a.NSP11 ei esiinny 
 pitkässä proteiinissa  RRF1ab, pp1ab, sillä siinä kohtaa 
tapahtuu framshift, ja toisaalta frame slippage. 
 

 
 

Inga kommentarer:

Skicka en kommentar