Leta i den här bloggen

söndag 19 maj 2019

MItä solun luonnollisessa puolustuksessa tapahtuu virusinfektiossa?



2019 Apr 17;10:836. doi: 10.3389/fimmu.2019.00836. eCollection 2019.

Analysis of Global Transcriptome Change in Mouse Embryonic Fibroblasts After dsDNA and dsRNA Viral Mimic Stimulation.

Abstract

The activation of innate immunity by viral nucleic acids present in the cytoplasm plays an essential role in controlling viral infection in both immune and non-immune cells. The dsDNA and dsRNA viral mimics can stimulate the cytosolic nucleic acids sensors and activate the antiviral innate immunity.
 In this study, taking advantage of dsDNA and dsRNA viral mimics, we investigated the global transcriptome changes after the antiviral immunity activation in mouse embryonic fibroblasts.

Results from our data identified a positive feedback up-regulation of sensors (e.g., Tlr2, Tlr3, Ddx58, cGAS), transducers (e.g., Traf2, Tbk1) and transcription factors (e.g., Irf7, Jun, Stat1, Stat2) in multiple pathways involved in detecting viral or microbial infections upon viral mimic stimulation.

A group of genes involved in DNA damage response and DNA repair such as Parp9, Dtx3l, Rad52 were also up-regulated, implying the involvement of these genes in antiviral immunity.

Molecular function analysis further showed that groups of helicase genes (e.g., Dhx58, Helz2), nuclease genes (e.g., Dnase1l3, Rsph10b), methyltransferase genes (e.g., histone methyltransferase Prdm9, Setdb2; RNA methyltransferase Mettl3, Mttl14), and protein ubiquitin-ligase genes (e.g., Trim genes and Rnf genes) were up-regulated upon antiviral immunity activation.

 In contrast, viral mimic stimulation down-regulated genes involved in a broad range of general biological processes (e.g., cell division, metabolism), cellular components (e.g., mitochondria and ribosome), and molecular functions (e.g., cell-cell adhesion, microtubule binding).

 In summary, our study provides valuable information about the global transcriptome changes upon antiviral immunity activation.

 The identification of novel groups of genes up-regulated upon antiviral immunity activation serves as useful resource for mining new antiviral sensors and effectors.

KEYWORDS:

genome-wide analysis; innate immunity; mouse embryonic fibroblasts; transcriptional profiling; viral mimic stimulation
PMID:
31057555
PMCID:
PMC6478819
DOI:
10.3389/fimmu.2019.00836

fredag 17 maj 2019

Sisäisestä genomisesta antiviruspuolustuksesta esimerkkiä

 Histoni H3.3
Geeni HIRA (22q11.21) , histone cell cycle regulator
DGCR1, HIRA, TUP1, TUPLE1 (22q11.21)
https://academic.oup.com/nar/article/45/20/11673/4128795

Histone chaperone HIRA deposits histone H3.3 onto foreign viral DNA and contributes to anti-viral intrinsic immunity

Nucleic Acids Research, Volume 45, Issue 20, 16 November 2017, Pages 11673–11683, https://doi.org/10.1093/nar/gkx771
Published:
13 September 2017
Article history

Abstract



The HIRA histone chaperone complex deposits histone H3.3 into nucleosomes in a DNA replication- and sequence-independent manner. As herpesvirus genomes enter the nucleus as naked DNA, we asked whether the HIRA chaperone complex affects herpesvirus infection. After infection of primary cells with HSV or CMV, or transient transfection with naked plasmid DNA, HIRA re-localizes to PML bodies, sites of cellular anti-viral activity. HIRA co-localizes with viral genomes, binds to incoming viral and plasmid DNAs and deposits histone H3.3 onto these. Anti-viral interferons (IFN) specifically induce HIRA/PML co-localization at PML nuclear bodies and HIRA recruitment to IFN target genes, although HIRA is not required for IFN-inducible expression of these genes. HIRA is, however, required for suppression of viral gene expression, virus replication and lytic infection and restricts murine CMV replication in vivo. We propose that the HIRA chaperone complex represses incoming naked viral DNAs through chromatinization as part of intrinsic cellular immunity.


tisdag 7 maj 2019

Norjalainen nuori nainen menehtyi rabiekseen

https://www.aftonbladet.se/nyheter/a/WboE5j/rabiessmittad-ung-kvinna-har-dott

NYHETER
Hon smittades med rabies efter att ha blivit biten av en hund i Asien.
Nu har kvinnan i 20-årsåldern dött på sjukhus i Norge.

Väl hemma har personen blivit sämre och sämre och sökte vård på sjukhuset i Førde, på norska västkusten.
I torsdags förra veckan las kvinnan in på centralsjukhuset i Førde på norska västkusten.
Hon var förvirrad och när det framkom att hon blivit biten av en hund under en semesterresa i Sydostasien för två månader sedan misstänkte sjukhuset i Førde att hon smittats av rabies.
Prover skickades till Folkhälsomyndigheten i Sverige som i lördags bekräftade misstankarna:
Den unga kvinnan hade rabies.
– Patienten var inlagd på vår intensivavdelning och dog lugnt och stilla tidigt på måndagskvällen, omgiven av sin familj, säger Trine Hunskår Vingsnes, chef vid sjukvården i Fønde, i ett pressmeddelande.
Det är första gången sedan 1815 som en norsk medborgare på fastlandet har drabbats av rabies.
Kvinnan bodde i Sogn og Fjordarne på norska västkusten, enligt VG.
De andra som var med på samma resa kom också i kontakt med samma hund, som bet turisten, men de bor på andra platser i Norge.
Smittskyddsansvariga i deras respektive hemkommuner är larmade och har vidtagit nödvändiga åtgärder.
Rabies smittar via saliv, vanligtvis från hundar, men någon dokumentation om att det har smittat mellan människor finns inte.
Sjukdomen förekommer mest i Asien, Afrika och Nord-, Mellan- och Sydamerika.
Rabies är en dödlig sjukdom om du inte får vård tidigt.
Symtomen är domningar och smärta kring bettet, ångest,  hallucinationer, huvudvärk, förvirring och kramper – och har sjukdomen gått så långt är den alltid dödlig.