Kertausta HIV genomista

http://www.mcld.co.uk/hiv/?q=HIV%20genome

HIV genomi

Kokopitkää HIV genomia koodaa yksi pitkä RNA säie. Vapaassa viruspartikkelissa on  varsinaisesti kaksi tällaista   erillistä, täysin samnlaista RNA säiettä. Tämä on se (tiivein)  muoto, mikä tällä viruksella on, kun se on vapaana viruspartikkelina. Mutta kun virus integroituu isännän omistamaan DNA- genomiin ( proviruksena),  viruksen genominen sisältö on koodautuneena myös DNA- muotoisena.

This is the form it has when it is a free virus particle. When the virus is integrated into the host's DNA genome (as a provirus) then its information too is encoded in DNA.

Alla on  yksinkertaisen kaavamaisesti kuvattuna, miten geenit ovat asettautuneena HIV virukseen. On muistettava, että HIV- 1 ja HIV-2 virukset ovat aika erilaisia. Alla on geenien nimet luettelona ja niistä saa lisätietoa klikkaamalla.

The following image shows roughly how the genes are laid out in HIV (remember that HIV-1 and HIV-2 are quite different). Click on a gene's name for more information.

This diagram is based on a fantastic map of the HIV-1, HIV-2, and SIV genomes, available at
hiv-web.lanl.gov/content/immunology/pdf/2000/intro/GenomeMaps.pdf

HIV genomin geenit ovat seuraavat:
The genes in HIV's genome are as follows:

• gag (coding for the viral capsid proteins)
• pol (notably, coding for reverse transcriptase)
(NB. gag and pol together can be expressed in one long strand called "gag-pol")
• env (coding for HIV's envelope-associated proteins)
And the regulatory genes ( Säätelevät geenit ovat seuraavat) 
• tat
• rev
• nef
• vif
• vpr
• vpu (N.B. not present in HIV-2)
• vpx (N.B. not present in HIV-1)

 HIV genomissa on myös  genomin molemman päädyn pitkä toistojakso  (LTR), mikä ei ole varsinainen geeni vaan RNA/DNA sekvenssi, mikä on samanlainen molemmissa päädyissä  ja sillä on joitain rakenteellisia ja säätelyllisiä tarkoituksia. 

The HIV genome also has a "Long Terminal Repeat" (LTR) at each end of its genome - not quite a gene, but a sequence of RNA/DNA which is the same at either end and which serves some structural and regulatory purposes.