Sivutie: TETRASPANIINI. Ihmisellä 33 tetraspaniinia

Jotta voisi päästä eteenpäin soluinteraktioiden kuvaamisessa HIV-1 viruksen vastaisessa taistelussa, niin täytyy ensin katsoa WIKIPEDIASTA mikä on tetraspaniini. Sellaista ei tosiaan ollut kirjoissa eikä kansissa siihen aikaan kun luin lääketiedettä. Eihän silloin edes tiedetty että HIV ja sen globaali vaara edes on olemassakaan.

Siis katsaus wikipediaan ja sitaatti ja suomennosta:
Tetraspanins are a family of membrane proteins found in all multicellular eukaryotes.

• Tetraspaniini on solukalvon proteiiniperhe ja esiintyy kaikissa monisoluisissa eukaryosyyteissä.

Tetraspanins, also called tetraspans or the transmembrane 4 superfamily (TM4SF), have four transmembrane domains, intracellular N- and C-termini and two extracellular domains, one short (called the small extracellular domain or loop, SED/SEL or EC1) and one longer, typically 100 amino acid residues (the large extracellular domain/loop, LED/LEL or EC2).

• Tetraspaniinit tai tetraspanit tai transmembraaninen 4 superperhe TM4SF on saanut nimensä siitä, että proteiini kelluu kiemurtelee solukalvossa siten, että neljä kertaa siinä on transmembraaninen jakso ( kalvolehtien välinen jakso), sitten siinä on solunsisäisinä N-terminaali ja C-terminaali ja solun ulkopuolelle tulee kaksi silmukkaa, extrasellulaariset domaanit, joista toinen on lyhempi (SED, SEDL, small-extracellular domain-loop) ja toinen siis pidempi sata aminohappoa sisältävä LED, LEL tai EC2 ( large- extracellular domain/loop).

Although several protein families have four transmembrane domains, tetraspanins are defined by conserved domains listed in the Protein Families database under pfam00335.12.^[1] The key features are four or more cysteine residues in the EC2 domain, with two in a highly conserved 'CCG' motif.

• On montakin sellaista proteiiniperhettä, jossa sattuu olemaan neljä jaksoa transmembraanisessa tilassa, mutta tetraspaniinit on määritelty konservatiivisten domaaniensa mukaan ja luetteloitu proteiiniperheitten tietueissa pfam00335.12. Avainpiirteenä on neljä tai useampi kysteiiniaminohappo EC2 domaanissa ja kahdessa on hyvin konservatiivinen CCG-motiivi.

Research into this field is relatively recent (less than 20 years) and therefore there is much to learn about the function of specific tetraspanins. Generally, tetraspanins are often thought to act as scaffolding proteins, anchoring multiple proteins to one area of the cell membrane.

• Tämän aihepiirin tutkimuksia on tehty vajaat 20 vuotta, joten eri tetraspaniineista on paljon asiaa. Niitä on yleisesti pidetty tukirakenneproteiineina, jotka ankkuroivat monia muita proteiineja johonkin solukalvon alueeseen.

Tetraspanins are highly conserved between species. Some tetraspanins can have N-linked glycosylations on the long extracellular loop (LEL, EC2) and palmitoylations at a CXXC motif in their transmembrane region.

• Tetraspaniinit ovat lajivälissä hyvin konservoituneita. Joissain tetraspaniineissa voi olla N-linkkiytynyt glykosylaatio pitkässä solun ulkopuolelle sojottavassa silmukassa (LAL) ja palmitylaatio (C16:0 rasvahappo) CXXC-motiivissa transmembraani( kalvolehtien välisessä lipidi-) alueessa.

There are 34 tetraspanins in mammals, 33 of which have also been identified in humans. Tetraspanins display numerous properties that indicate their physiological importance in cell adhesion, motility, activation and proliferation, as well as their contribution to pathological conditions such as metastasis or viral infection.

• Imettäväisissä ( mammalia) esiintyy 34 tetraspaniinia ja ihmisestä on löydetty niistä 33 kpl. Tetraspaniineilla on lukuisia ominaisuuksia jotka viittaavat niiden olevan fysiologisesti tärkeitä solun kiinnittäytymisessä, liikkumisessa, aktivoitumisessa ja proliferaatiossa, mutta niillä on osuutta myös patologisissa tiloissa kuten metastasoitumisessa tai virusinfektiossa.

A role for tetraspanins in platelets was demonstrated by the bleeding phenotypes of CD151- and TSSC6-deficient mice, which exhibit impaired "outside-in" signalling through α_IIbβ₃, the major platelet integrin. it is hypothesized that tetraspanins interact with and regulate other platelet receptors.

• Verihiutaleista eli trombosyyteistä on koehiirillä osoitettu tetraspaniinin tehtävä. Oletetaan tetraspaniinin käyvän vuorovaikutukseen verihiutaleen reseptorien kanssa tai säätelevän niitä.
• 1. Ihmisen tetraspaniinien lista . Ihmisen CD- molekyylien lista

1 List of human tetraspanins

Protein	Gene	Aliases
TSPAN1	TSPAN1	TSP-1
TSPAN2	TSPAN2	TSP-2
TSPAN3	TSPAN3	TSP-3
TSPAN4	TSPAN4	TSP-4, NAG-2
TSPAN5	TSPAN5	TSP-5
TSPAN6	TSPAN6	TSP-6
TSPAN7	TSPAN5	CD231/TALLA-1/A15
TSPAN8	TSPAN8	CO-029
TSPAN9	TSPAN9	NET-5
TSPAN10	TSPAN10	OCULOSPANIN
TSPAN11	TSPAN11	CD151-like
TSPAN12	TSPAN12	NET-2
TSPAN13	TSPAN13	NET-6
TSPAN14	TSPAN14
TSPAN15	TSPAN15	NET-7
TSPAN16	TSPAN16	TM4-B
TSPAN17	TSPAN17
TSPAN18	TSPAN18
TSPAN19	TSPAN19
TSPAN20	UPK1B	UP1b, UPK1B
TSPAN21	TSPAN21	UP1a, UPK1A
TSPAN22	PRPH2	RDS, PRPH2
TSPAN23	TSPAN23	ROM1
TSPAN24	CD151	CD151
TSPAN25	CD53	CD53
TSPAN26	CD37	CD37
TSPAN27	CD82	CD82
TSPAN28	CD81	CD81
TSPAN29	CD9	CD9
TSPAN30	CD63	CD63
TSPAN31	TSPAN31	SAS
TSPAN32	TSPAN32	TSSC6
TSPAN33	TSPAN33
TSPAN34	TSPAN34

• List of human clusters of differentiation

Relevance to parasite vaccines

The schistosome worms make two tetraspanins: TSP-1 and TSP-2. TSP-2 antibodies are found in some people who seem to have immunity to schistosome infection (Schistosomiasis).^[5]

• InterPro on Tetraspanins
• Comprehensive list of human tetraspanins"

(Tässä vaiheessa jatkan tetraspaniinien roolista HIV-1 infektiossa)
http://en.wikipedia.org/wiki/Tetraspanin
Wikipedia näyttää myös kuvan tetraspaniinista, kuin "kaksi vierekkäistä erikokoista krokettipelin porttia"