HBV virusgenomista

LÄHDE: Alestig Erik. Geographic and genetic diversity of Hepatitis B.
ISBN 978-91-628-8182-5.

HBV
HEPADNAVIRIDAE perhe

Orthohepadnaviruses esiintyvät nisäkkäissä ja kädellisissä.

Avihepadnaviruses esiintyvät linnuissa kuten ankoissa, haikaroissa ja kurjissa.

HBV genomi on pieni kovalentti sirkulaarinen (CCC), osittain kaksoissäikeinen DNA (dsDNA). Molekyylikoko on 3.2 kb nt.

VIRION omaa myös nimen the Dane particle

Ulompi lipidikaksoiskerros (outer lipid bilayer), pinta, surface(s) käsittää kolme vaippaproteiinia ( envelope proteins, HBsAg) ja sen funktiona on sulkea sisäänsä ydinkapsidi.
Kaikki kolme HBsAg laatua translatoituvat samasta lukukohdasta ( reading frame), mutta alkukodoni (start codon) on eri.
Nämä proteiinit ovat nimeltään
SHBs( p24/gp27)
MHBs (gp33/gp36)
LHBs (p39/gp42).
Näitä proteiineja tuottuu suhteessa 4:1:1.

Tämän lisäksi erittyy koko joukko HBsAG molekyylejä solun ulkopuolelle 22 nanometrin läpimittaisissa pallomaisissa partikkeleissa, jotka koostuvat pienistä HBsAg partikkeleista tai sauvamaisissa filamenttipartikkeleissa, jotka sisältävät kaikkia HBsAg kokoja.

http://www.hepatitisbviruspage.com/hbv7.jpg


VIRUSKAPSIDI muodostuu
ydinproteiinista (core protein HBcAg).
Lisäksi DNA genomiin liittyneenä on polymeraasin, jossa on käänteinen transskriptaasi ( reverse transscriptase) ja ribonukleaasi H aktiviteetti ( ribonuclease H).

ERITEPROTEIINIT
Yllämainittujen proteiinien lisäksi HBV-infektoituneet solut tuottavat e-antigeenia HBeAg, jota erittyy seerumiin ja se on proteiini, jolla on immuunisäätelyvaikutuksia.


Lisäksi erittyy proteiini X, jolla oletetaan olevan myös ( vielä epätäydellisesti tunnettu) säätelyfunktio.

Nämä ovat siis HBV viruksen seitsemän proteiinia:

• envelope proteins, vaippaproteiinit HBsAgs "Australian antigen"
  

SHBs
MHBs
LHBs

• Core protein, Ydinkapsidiproteiinit

HBcAg
polymeraasi:reverse, transcriptase, ribonuclease

• Erittyvät proteiinit

e-antigeni HBeAg
proteiini X


Vuonna 1976 annettiin Nobelin palkinto Blomberg et al löydöstä 1965: Australian antigene, HBsAg

• Vert. linnun hepadnavirus

Se on hieman poikkeava nisäkkäiden ja kädellisten hepadnaviruksista.
Esimerkkinä kirja mainitsee ankan(duck) hepatiitti B viruksen DHBV. Sen DNA on miltei täysi rinkula kaksinkertaista DNA säiettä. Se koodaa vain kahta pintaproteiinia ( surface proteins, S). Siitä puuttuu X-geeni. Se on useita satoja emäksiä lyhempi rakenteeltaan.

jatkuu ...HBV replikaatiosta